文|《中國科學(xué)報》記者 孟凌霄
廣東珠三角的初夏清晨,水稻試驗田偶爾傳來微風(fēng)拂過禾苗的沙沙聲。幾位育種科研人員正沿著田壟察看農(nóng)田情況,遠(yuǎn)處無人機盤旋,實時采集水稻的表型數(shù)據(jù)——株高、籽粒大小、葉片色澤、穗形結(jié)構(gòu)等要素,看似簡單,卻蘊藏著育種科研最關(guān)鍵的基礎(chǔ)信息。
“過去育種靠的是一把尺子、一桿秤。”華南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院院長儲成才笑言,傳統(tǒng)育種靠經(jīng)驗和眼力打底,是一項耗時費力的“慢功夫”。如今,水稻、麥子、玉米……這些關(guān)乎中國人一日三餐的作物,正經(jīng)歷著從試驗田到實驗室,從經(jīng)驗育種到數(shù)據(jù)驅(qū)動的變革。
科研人員查看農(nóng)田情況。
就在距離試驗田不遠(yuǎn)的華南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院的實驗室里,一幅幅可視化的“數(shù)字農(nóng)田”正徐徐鋪展開來。電腦屏幕上成千上萬的數(shù)據(jù)實時跳動,繪制出作物基因與表型的聯(lián)系圖譜。悄然運轉(zhuǎn)的高通量生物數(shù)據(jù)分析處理平臺,正在深刻改變農(nóng)業(yè)科研的范式。
育種革命:從農(nóng)田到算力
在華南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院的育種基地,幾代育種學(xué)家曾默默耕耘,培育出多個高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)的水稻品種。但鮮為人知的是,從發(fā)現(xiàn)第一株天然雜交水稻到全國推廣,經(jīng)歷了漫長的16年。
育種,需要在時間中尋找答案。育種學(xué)家憑借多年經(jīng)驗選取親本,再一代代觀察田間表現(xiàn),數(shù)據(jù)依靠手動記錄,致使主觀性強、效率低,甚至容易造成遺傳多樣性流失。
以玉米為例,由于未經(jīng)歷水稻作物那樣的“綠色革命”,抗倒伏和耐密植性狀仍是科研難點。面對數(shù)量龐大的基因組,單靠人力很難實現(xiàn)高效篩選,育種進度受到極大限制。
如今,隨著生物信息學(xué)與AI技術(shù)的發(fā)展,育種正在經(jīng)歷一場由生物信息學(xué)、AI算法與算力平臺共同驅(qū)動的深層革新。如今的每一粒種子,都擁有一本包含幾萬個基因的基因組“信息天書”,背后蘊藏著海量的性狀信息。
每一粒種子都蘊藏著海量的性狀信息。
在華南農(nóng)業(yè)大學(xué),這種改變由高通量生物數(shù)據(jù)分析處理平臺統(tǒng)籌實現(xiàn)。依托浪潮信息的模塊化數(shù)據(jù)中心解決方案構(gòu)建的金穗智算中心,學(xué)校搭建起涵蓋數(shù)據(jù)采集、處理、建模與可視化的一體化科研平臺,實現(xiàn)了從“田間”到“計算”再回到“田間”的閉環(huán)。
“2000份親本材料,如果兩兩雜交,那就有400萬個雜交組合,我們需要對這400萬個組合不斷進行鑒定和選擇。而通過AI構(gòu)建模型,可以快速篩選出具有高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)潛力的親本組合。”華南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院研究員、國家植物航天育種工程技術(shù)研究中心主任郭濤介紹,如今的育種者從“先看見再選擇”到“先預(yù)測再驗證”,大大提高了高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)品種的選育效率。
目前,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)高通量生物數(shù)據(jù)分析處理平臺已服務(wù)于農(nóng)學(xué)院、園藝學(xué)院、生科院、植保學(xué)院、林風(fēng)學(xué)院等的39個課題組,涵蓋水稻、玉米、大豆及園藝作物等多個研究方向,截至2024年12月31日,總計任務(wù)數(shù)量為336721個。通過浪潮信息的Cluster Engine和AIStation,將計算資源利用率提升到90%以上,通過充分利用算力資源,可滿足數(shù)十名科研人員同時使用。
成果落地:從算力回歸農(nóng)田
科研創(chuàng)新最終要回歸田野、落地生根。
以國家植物航天育種工程技術(shù)研究中心主導(dǎo)的多個育種項目為例,通過高通量平臺的數(shù)據(jù)篩選與基因定位,科研人員得以在短時間內(nèi)完成對多種抗逆性狀的精準(zhǔn)評估與篩選,有效縮短了育種周期。
該中心培育的水稻新品種“華航香銀針”,已在百畝示范片中實現(xiàn)單季平均畝產(chǎn)723.5公斤。該品種田間長勢均衡、株型好、有效穗數(shù)多、穗大、結(jié)實率高、熟色好,達到農(nóng)業(yè)農(nóng)村部設(shè)定的華南稻區(qū)雙季稻“超級稻”產(chǎn)量指標(biāo)。
這些成果背后,是高通量生物數(shù)據(jù)分析處理平臺對數(shù)據(jù)質(zhì)量的嚴(yán)格把控和智能分析能力的全面釋放。每一項數(shù)據(jù)采集和處理都經(jīng)過層層校驗,確保了科研數(shù)據(jù)的高度可靠,直接推動了育種品質(zhì)的提升和新品種的產(chǎn)業(yè)化。
浪潮信息模塊化數(shù)據(jù)中心解決方案支撐金穗智算中心建設(shè)。
“我認(rèn)為的AI育種、智能育種,其實就是幫助育種家做育種方案的設(shè)計。所謂育種方案的設(shè)計,牽涉到親本怎么選、后代種多大的群體、怎么做篩選等關(guān)鍵問題。如果AI能在這些決策環(huán)節(jié)發(fā)揮作用,那才是真正的智能育種。”郭濤感慨道。
這種“從田間到算力再到田間”的轉(zhuǎn)變,為整個育種工作帶來了前所未有的靈活性與前瞻性。正是通過高通量平臺與AI系統(tǒng)的深度融合,科研人員能夠在更早階段、更大數(shù)據(jù)量下對目標(biāo)性狀進行精準(zhǔn)判斷,加速實現(xiàn)從“實驗室突破”到“田間豐收”的閉環(huán)。
未來:農(nóng)業(yè)“黃金時代”啟幕
站在農(nóng)業(yè)科研的前沿,育種的智能化進程仍在提速。
未來,隨著種質(zhì)資源庫的持續(xù)擴展、AI算法的不斷優(yōu)化,科研人員將在種質(zhì)鑒定、性狀挖掘、環(huán)境響應(yīng)預(yù)測等關(guān)鍵環(huán)節(jié)實現(xiàn)更大突破。經(jīng)驗與規(guī)律不再遙不可及,而是由數(shù)據(jù)、算法、平臺與一代代年輕農(nóng)學(xué)人共同構(gòu)建。
科研人員繪制圖譜。
放眼全球,智慧育種正成為農(nóng)業(yè)科技的重要前沿領(lǐng)域,國際國內(nèi)均有多個團隊投入其中,形成了多樣化的技術(shù)路徑與研究重點。
“我們團隊的研究重點在于資源的高效利用。”儲成才介紹道,“比如,在同樣的種植條件下,如何用更少的化肥投入獲得更高的產(chǎn)出?我們希望通過數(shù)據(jù)分析和智能輔助決策,實現(xiàn)投入產(chǎn)出效率最大化。”
在這一轉(zhuǎn)變中,高通量生物數(shù)據(jù)分析處理平臺將成為科研鏈條中不可或缺的中樞系統(tǒng)。依托平臺,育種科研正從田間走向?qū)嶒炇遥倩貧w田間。這不僅提高了科研效率,也意味著資源更節(jié)約、生態(tài)更友好、成果轉(zhuǎn)化更高效。
一粒種子的“AI之旅”,不僅是一場科研范式的革新,也折射出中國農(nóng)業(yè)向智能化、綠色化、可持續(xù)方向邁進的整體趨勢。未來,科研與農(nóng)業(yè)將更加深度融合,在算力與算法的加持下,迎來一個真正的“黃金時代”。
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