近日，中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所飼草育種創新團隊和博瑞迪生物技術有限公司合作，成功研發了紫花苜蓿“苜蓿芯1.0”低密度5K液相育種芯片。
據介紹，紫花苜蓿是全球重要的豆科牧草，粗蛋白含量高，營養價值豐富，被譽為“牧草之王”。當前，國內外紫花苜蓿育種仍以常規選育為主，育種周期長，提升育種效率的分子育種技術尚未在紫花苜蓿育種過程中進行大規模應用。
分子育種技術的大規模推廣應用依賴于分子標記成本的降低與準確率的提高，開發低密度的育種芯片，不但可以提高檢測效率，避免標記冗余、還可以降低成本。因此，有必要開發精準高效的低密度育種芯片。
中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所飼草育種創新團隊30多年來，一直從事紫花苜蓿的遺傳育種工作。先后育成中苜1號、中苜2號、中苜3號等八個中苜系列苜蓿新品種，中苜系列品種已在華北、西北大面積種植，產生了較大的經濟效益、社會效益和生態效益。
此次該團隊研發的“苜蓿芯1.0”5K液相育種芯片，依托220份來源于全球各地的紫花苜蓿核心種質資源的全基因組重測序數據，采用博瑞迪GBTS技術設計開發而成。
該芯片整合了覆蓋紫花苜蓿全基因組的5037個單核苷酸位點集合，并包含94個與產量、品質、抗逆性以及秋眠性等重要性狀相關的候選功能位點。利用該芯片對項目組334份紫花苜蓿育種材料進行測試試驗，樣本檢測成功率為100%，位點平均檢出率高達99.08%，實現了不同種質資源基因型的精準鑒定。
據悉，該芯片具有準確率高、檢測成本低、靈活性高等特點，后續可用于紫花苜蓿種質資源亞群劃分，輔助品種鑒定與育種，提高紫花苜蓿育種選擇效率，對我國苜蓿種業發展具有重要意義。
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