近日，復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院邵志敏、江一舟團隊，上海市生物醫(yī)藥技術(shù)研究院黃薇團隊，復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院和人類表型組研究院石樂明/鄭媛婷團隊協(xié)同攻關(guān)，繪制出迄今為止最大規(guī)模的亞洲人群全乳腺癌多維組學(xué)圖譜，相關(guān)研究在線發(fā)表于《自然—癌癥》。
在前期研究中，邵志敏、江一舟團隊等基于高通量檢測技術(shù)，對乳腺癌基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、代謝組，以及醫(yī)學(xué)影像和病理圖像等不同層面的數(shù)據(jù)進行了分析，部分揭示了乳腺癌的發(fā)病機理和治療靶點，將乳腺癌“分型精準”的治療策略不斷升級。在此基礎(chǔ)上，研究團隊開展了多組學(xué)、多維度的項目研究，以通過不同組學(xué)、多維度的信息協(xié)同，實現(xiàn)“1+1大于2”的“立體式”效果。
研究發(fā)現(xiàn)，相比于西方人群，中國乳腺癌患者群體具有更高頻率的AKT1突變，且HER2富集亞型比例更高。基因組-轉(zhuǎn)錄組-蛋白組整合分析結(jié)果表明，HER2基因（ERBB2）在中國患者的癌癥發(fā)生發(fā)展中起主導(dǎo)作用，這與既往臨床研究結(jié)果相吻合，證實了多組學(xué)整合策略的價值。
進一步地，研究人員系統(tǒng)性描繪了乳腺癌各亞型的代謝特點，通過整合代謝組和蛋白組信息，發(fā)現(xiàn)基底樣亞型乳腺癌脂質(zhì)過氧化水平及鐵死亡相關(guān)蛋白表達量更高，從而提出在這類腫瘤中靶向鐵死亡的治療新策略。此外，在激素受體陽性/HER2陰性乳腺癌中發(fā)現(xiàn)一群以免疫細胞富集為特征的患者，擴展了免疫檢查點抑制劑治療的潛在獲益人群。
為實現(xiàn)精準的患者風險分層和預(yù)后預(yù)測，研究人員基于前期的數(shù)據(jù)庫搭建和多模態(tài)融合技術(shù)，構(gòu)建了基于機器學(xué)習(xí)的多模態(tài)風險分層模型。TMPIC模型融合了轉(zhuǎn)錄組（T）、代謝組（M）、數(shù)字病理（P）特征、免疫組化分型（I）及臨床分期（C），較臨床常用指標能更好地預(yù)測乳腺癌患者復(fù)發(fā)風險，為乳腺癌患者的精準分層提供了有力的工具。
相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1038/s43018-024-00725-0
本文鏈接：迄今最大規(guī)模亞洲人群全乳腺癌多維組學(xué)圖譜問世http://m.sq15.cn/show-11-3067-0.html
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