近日，中國科學(xué)院微生物所王碩團(tuán)隊(duì)在黏膜固有淋巴細(xì)胞譜系分化研究方面取得進(jìn)展。該研究系統(tǒng)揭示了固有淋巴細(xì)胞前體細(xì)胞（ILCPs）的表觀遺傳印記，在決定細(xì)胞譜系分化中的重要作用。
ILCs是黏膜組織中的重要淋巴細(xì)胞亞群，在黏膜穩(wěn)態(tài)維持中發(fā)揮重要作用。然而，其譜系分化的表觀遺傳調(diào)控機(jī)制尚不清楚。
為了研究ILCPs的異質(zhì)性，以及ILCPs向ILC各亞類細(xì)胞分化過程中，轉(zhuǎn)錄組和表觀遺傳修飾的改變，研究團(tuán)隊(duì)同時(shí)繪制了ILC各亞群，及ILCPs的單細(xì)胞DNA甲基化、染色質(zhì)可及性和轉(zhuǎn)錄組圖譜，發(fā)現(xiàn)ILCPs可分為兩個(gè)亞群（ILCP1和ILCP2）。ILCP2s呈現(xiàn)高度異質(zhì)的DNA甲基化特征，并可依據(jù)其DNA甲基化特性進(jìn)一步分為三類（ILCP2-ILC1、ILCP2-ILC2和ILCP2-ILC3），這些ILCP2亞群的DNA甲基化特征與其分化的ILC亞群相對(duì)應(yīng)。
研究團(tuán)隊(duì)鑒定了各ILCP2亞群的標(biāo)志性甲基化區(qū)域（SMRs），并在ILCPs分化過程中，對(duì)SMRs的DNA甲基化印記進(jìn)行了譜系示蹤。研究發(fā)現(xiàn)，攜帶與特定ILC亞群相對(duì)應(yīng)低甲基化SMRs的ILCP2s，能夠特異的分化為相應(yīng)的ILC亞群。對(duì)SMRs進(jìn)行DNA甲基化編輯會(huì)抑制ILCs的譜系分化。在ILCPs中敲除DNA甲基化酶Dnmt1，會(huì)破壞SMRs的異質(zhì)性分布，并導(dǎo)致ILC分化缺陷。
上述結(jié)果表明，表觀遺傳印記在ILCPs發(fā)育分化過程中驅(qū)動(dòng)了譜系定向分化方向。該研究為進(jìn)一步理解黏膜免疫細(xì)胞發(fā)育中的表觀遺傳調(diào)控提供了新見解。
相關(guān)研究成果發(fā)表在《自然-免疫學(xué)》（Nature Immunology）上。
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ILC各亞群及ILCPs的單細(xì)胞多組學(xué)圖譜與DNA甲基化印記示蹤
本文鏈接：研究揭示表觀遺傳印記驅(qū)動(dòng)固有淋巴細(xì)胞譜系分化核心機(jī)制http://m.sq15.cn/show-12-1819-0.html
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