記者4月9日從中國農業科學院獲悉，全球首個榕屬植物對葉榕端粒到端粒完整基因組發布，修正了原有基因組中存在的多個間隙和組裝錯誤，大幅提升了對葉榕基因組的連續性、完整性和準確性。相關研究成果日前發表在國際期刊《園藝研究》上。
榕樹是桑科榕屬800多種植物的統稱，廣泛分布于熱帶和亞熱帶地區，榕屬植物包含6個亞屬，其中對葉榕屬于聚果榕亞屬，是典型的功能雌雄異株植物。然而，對葉榕原有基因組中存在大量的信息缺失和組裝錯誤，阻礙了科研人員的進一步研究。
論文通訊作者、中國農業科學院深圳農業基因組研究所研究員張興坦告訴記者，該所農業基因組學技術研發與應用創新團隊綜合利用多種測序技術，在原有基因組基礎上重新組裝、完善，發布了首個榕屬植物對葉榕端粒到端粒完整基因組。該基因組大小為371.8兆，所有序列均掛載到14條染色體上，并準確解析了26642個編碼蛋白基因。經評估，該基因組完整度達98.7%，大幅提升了對葉榕基因組的連續性和準確性。
在此基礎上，研究人員進一步構建了對葉榕雄性和雌性花不同發育時期的基因調控網絡，并鑒定得到了雄花發育的關鍵基因，為研究榕屬植物重要特征和性別決定提供了重要資源。
“通過這項研究，我們不僅能更深入地理解榕樹的性別演變和關鍵生物學特性，還成功發現了可能的性別決定基因。同時，此次研究通過基因調控網絡，揭示了這些基因調控榕樹的性別表達和花發育過程，為植物性別決定機制和發育生物學提供了新的理論基礎。”論文第一作者、中國農業科學院深圳農業基因組研究所博士后廖振陽表示。
記者4月9日從中國農業科學院獲悉，全球首個榕屬植物對葉榕端粒到端粒完整基因組發布，修正了原有基因組中存在的多個間隙和組裝錯誤，大幅提升了對葉榕基因組的連續性、完整性和準確性。相關研究成果日前發表在國際期刊《園藝研究》上。
榕樹是?？崎艑?00多種植物的統稱，廣泛分布于熱帶和亞熱帶地區，榕屬植物包含6個亞屬，其中對葉榕屬于聚果榕亞屬，是典型的功能雌雄異株植物。然而，對葉榕原有基因組中存在大量的信息缺失和組裝錯誤，阻礙了科研人員的進一步研究。
論文通訊作者、中國農業科學院深圳農業基因組研究所研究員張興坦告訴記者，該所農業基因組學技術研發與應用創新團隊綜合利用多種測序技術，在原有基因組基礎上重新組裝、完善，發布了首個榕屬植物對葉榕端粒到端粒完整基因組。該基因組大小為371.8兆，所有序列均掛載到14條染色體上，并準確解析了26642個編碼蛋白基因。經評估，該基因組完整度達98.7%，大幅提升了對葉榕基因組的連續性和準確性。
在此基礎上，研究人員進一步構建了對葉榕雄性和雌性花不同發育時期的基因調控網絡，并鑒定得到了雄花發育的關鍵基因，為研究榕屬植物重要特征和性別決定提供了重要資源。
“通過這項研究，我們不僅能更深入地理解榕樹的性別演變和關鍵生物學特性，還成功發現了可能的性別決定基因。同時，此次研究通過基因調控網絡，揭示了這些基因調控榕樹的性別表達和花發育過程，為植物性別決定機制和發育生物學提供了新的理論基礎。”論文第一作者、中國農業科學院深圳農業基因組研究所博士后廖振陽表示。
本文鏈接：全球首個對葉榕完整基因組發布http://m.sq15.cn/show-2-4724-0.html
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