6月10日記者獲悉，華大生命科學研究院聯合國際半干旱熱帶作物研究中心、西澳大學、莫道克大學等單位，成功組裝了8個一年生鷹嘴豆屬野生種基因組，并結合已發表的2個鷹嘴豆基因組，構建出鷹嘴豆屬超級泛基因組，為鷹嘴豆育種提供了重要數據資源和研究方向。相關研究成果日前發表在《自然·遺傳學》上。
鷹嘴豆是世界第三大豆類作物，被50多個國家種植和食用。但鷹嘴豆的遺傳背景相對狹窄，抵抗生物或非生物脅迫能力不足，限制了其育種改良。
研究構建的鷹嘴豆屬超級泛基因組由24827個基因家族組成。其中，14748個基因家族為核心基因，它們存在于鷹嘴豆屬所有物種中，主要參與生長、DNA修復、細胞通信等基本生物功能。6212個基因家族為可變基因，它們存在于鷹嘴豆屬的2個至8個物種中，主要參與防御響應、生長素響應、生物刺激響應等生物功能。
此外，研究團隊還鑒定出鷹嘴豆屬內存在的2944萬個單核苷酸多態性、633萬個小插入缺失和491937個結構變異，并通過將鑒定出的結構變異整合到參考基因組中，挖掘出477個鷹嘴豆屬個體中的變異多樣性。結果發現，這些變異在開花時間和抗病性等重要性狀中可能扮演重要角色。其中，678個結構變異與200個和開花相關的基因重疊，1667個結構變異與556個抗病基因重疊。
論文第一作者、國際半干旱熱帶作物研究中心高級科學家阿米爾·汗認為：“研究將野生近緣種這一非常重要的資源納入，可在更廣泛的基因多樣性基礎上挖掘農藝學性狀相關重要基因，有望推動鷹嘴豆品種的遺傳育種改良。”
6月10日記者獲悉，華大生命科學研究院聯合國際半干旱熱帶作物研究中心、西澳大學、莫道克大學等單位，成功組裝了8個一年生鷹嘴豆屬野生種基因組，并結合已發表的2個鷹嘴豆基因組，構建出鷹嘴豆屬超級泛基因組，為鷹嘴豆育種提供了重要數據資源和研究方向。相關研究成果日前發表在《自然·遺傳學》上。
鷹嘴豆是世界第三大豆類作物，被50多個國家種植和食用。但鷹嘴豆的遺傳背景相對狹窄，抵抗生物或非生物脅迫能力不足，限制了其育種改良。
研究構建的鷹嘴豆屬超級泛基因組由24827個基因家族組成。其中，14748個基因家族為核心基因，它們存在于鷹嘴豆屬所有物種中，主要參與生長、DNA修復、細胞通信等基本生物功能。6212個基因家族為可變基因，它們存在于鷹嘴豆屬的2個至8個物種中，主要參與防御響應、生長素響應、生物刺激響應等生物功能。
此外，研究團隊還鑒定出鷹嘴豆屬內存在的2944萬個單核苷酸多態性、633萬個小插入缺失和491937個結構變異，并通過將鑒定出的結構變異整合到參考基因組中，挖掘出477個鷹嘴豆屬個體中的變異多樣性。結果發現，這些變異在開花時間和抗病性等重要性狀中可能扮演重要角色。其中，678個結構變異與200個和開花相關的基因重疊，1667個結構變異與556個抗病基因重疊。
論文第一作者、國際半干旱熱帶作物研究中心高級科學家阿米爾·汗認為：“研究將野生近緣種這一非常重要的資源納入，可在更廣泛的基因多樣性基礎上挖掘農藝學性狀相關重要基因，有望推動鷹嘴豆品種的遺傳育種改良。”
本文鏈接：鷹嘴豆屬超級泛基因組構建http://m.sq15.cn/show-2-6813-0.html
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